我国的稀土产业按结构产业链划分可以分为稀土采选、治炼分离、深加工、稀土材料等。在稀土资源开发利用中，产生环境污染和生态破坏的环节主要集中在稀土资源开发的稀土采、选、治炼分离部分。我国政府和企业在环境和生态维护上的投入也主要集中在这些环节。因此，对全国稀土资源开发生态环境维护投入调查内容主要包括稀土资源矿产采选、冶炼分离各环节政府及企业的环境污染治理和生态恢复投入。
全国稀土资源开发生态环境维护投入的具体调查内容为：调查因矿产资源开发导致的水土整治、生态重建，以及采矿点关闭等生态环境维护恢复及运营投入成本，调查水、废气、固体废物、危险废物污染治理设施建设和运营投入成本，以及政府部门的环境监管成本。调查口径包括企业投入和政府部门投入。
近年来，在稀土资源开发生态环境维护方面，在政府层面上引导投入的主要有：
①财政部、工业和信息化部利用稀土产业支持的稀士产业调整升级专项;②生态环境部开展的稀土企业环保核查工作。因此，在调查时主要分析、总结了以上工作中政府、企业的投入。对于从更长时问尺度来说，地方政府、企业的维护投入，由于缺乏系统的数据统计、相关数据比较分散，并且在调研中数据难以获得，因此这部分维护投入并未统计在内。